原理是借沖洗水在排污管內形成虹吸作用，將污物排出，其排污口較小，使用起來噪音小，較為安靜。缺點是用水量大，一般6升儲存量一次用完。
結構是排水管道呈“s”型，在排水管道充滿水后會產生一定的水位差，借沖洗水在便器內的排污管內產生的吸力將便便排走，由于虹吸式坐便器沖排不是借助水流沖力，所以池內存水面較大，沖水噪音較小。虹吸式坐便器還分為旋渦式虹吸、噴射式虹吸兩種。
(1)旋渦式虹吸
這種坐便器沖水口設于坐便器底部的一側，沖水時水流沿池壁形成旋渦，這樣會加大水流對池壁的沖洗力度，也加大了虹吸作用的吸力，更利于將馬桶內的臟東西排出。
(2)噴射式虹吸
在虹吸式馬桶上做了進一步改進，在馬桶內底部增加一個噴射副道，對準排污口的中心，沖水時，水一部分從便圈周圍的布水孔流出，一部分由噴射口噴出，這種坐便器是在虹吸的基礎上借助較大的水流沖力，將污物快速沖走。
優點：虹吸式馬桶的*大優點就是沖水噪音小，稱之為靜音。從沖污能力上來說，虹吸式容易沖掉黏附在馬桶表面的污物，因為虹吸的存水較高，防臭效果優于直沖式，現 在市場上虹吸式坐便器品種繁多，買坐便器會有更多的選擇余地。